Основы масс-спектрометрии белков и пептидов

Читать фрагмент

книга

Основы масс-спектрометрии белков и пептидов

Автор: Альберт Лебедев, Константин Артеменко, Татьяна Самгина

Книга представляет собой первое учебное пособие на русском языке по основам масс-спектрометрии белков и пептидов. Цель настоящего издания - заинтересовать молодых исследователей информативной, красивой и востребованной во всем мире дисциплиной, дать возможность более эффективно применять масс-спектрометрию для решения фундаментальных и прикладных научных задач. Книга написана в формате лекций для начинающих, хорошо иллюстрирована и сопровождается представительным списком цитированной литературы.Издание рассчитано на студентов и аспирантов химических, физико-химических, биологических и медицинских специальностей; будет полезно научным сотрудникам, уже работающим в области исследований белков и пептидов или интересующимся этим научным направлением.

Форматы: PDF

Издательство: Техносфера

Год: 2012

Место издания: Москва

ISBN: 978-5-94836-334-9

Страниц: 180

Артикул: 17270

Возрастная маркировка: 16+

Электронная книга

299 ₽

Купить и скачать

Содержание

Содержание книги "Основы масс-спектрометрии белков и пептидов "

Предисловие

Использованные сокращения

Введение

Глава 1. Методы ионизации молекул пептидов и белков

1.1. Бомбардировка быстрыми атомами, ББА (Fast Аtom Bombardment, FAB)

1.2. Матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация, МАЛДИ (Martix Assisted Laser Desorption/Ionization, MALDI)

1.3. Ионизация электрораспылением, ИЭР (Electrospray Ionization, ESI)

Глава 2. Измерение молекулярной массы пептидов и белков

Глава 3. Установление первичной структуры пептидов

3.1. Деградация по Эдману

3.2. Идентификация пептидов по сиквенсу кДНК

3.3. Леддерное секвенирование

Глава 4. Масс-спектрометрическое секвенирование

4.1. Номенклатура фрагментных ионов пептидов

4.2. Масс-спектры отрицательных ионов

4.3. Методы инициирования фрагментации молекулярных ионов

4.3.1. Диссоциация, активированная соударениями, ДАС (Collisionally Activated Dissociation, CAD)

4.3.2. Диссоциация индуцированная столкновениями с поверхностью, ДИП (Surface Induced Dissociation (SID)

4.3.3. Диссоциация при захвате электрона, ДЗЭ (Electron Capture Dissociation, ECD)

4.3.4. Диссоциация при переносе электрона, ДПЭ (Electron Transfer Dissociation, ETD)

4.3.5. Фотоактивация диссоциации

4.3.6. Диссоциация, активированная электронами

4.3.7. Диссоциация отрицательных ионов при отрыве электрона

4.4. Методы секвенирования пептидов на приборах с матричноактивированной лазерной десорбцией/ионизацией

4.4.1. Метод задержанной экстракции. Распад в источнике, РВИ (In Source Decay, ISD)

4.4.2. Распад за пределами источника, РПИ (Post Source Decay, PSD)

Глава 5. Идентификация белков и пептидов

5.1. Идентификация с использованием баз данных

5.1.1. Метод идентификации белков "снизу вверх" ("Bottom-up")

5.1.2. Метод идентификации белков "сверху вниз" ("Top-down")

5.2. Ручная идентификация пептидов

Глава 6. Основные сложности масс-спектрометрического секвенирования пептидов и пути их преодоления

6.1. Покрытие сиквенса

6.2. Аминокислоты с одинаковой целочисленной массой

6.2.1. Лизин и глутамин

6.2.2. Фенилаланин и окисленный метионин

6.3. Изомерные аминокислоты: лейцин и изолейцин

6.4. Циклизация коротких пептидов

6.5. Пептиды, содержащие дисульфидную связь

Глава 7. Использование для секвенирования масс-спектров отрицательных ионов

Глава 8. Количественный анализ белков с использованием высокоэффективной жидкостной хроматографии - масс-спектрометрии. Количественная протеомика

8.1. Сравнительная (количественная) протеомика

8.1.1. Безизотопный метод

8.1.2. Изотопные методы

8.2. Установление абсолютных количеств

Список литературы

Приложение. Bruker: Многомерный путь к разгадке протеома

Отрывок из книги

Глава 1. Методы ионизации молекул пептидов и белков– 19 –Иониза ция аналита, протекающая путем поглощения энергии фотонов или в результате ионно-молекулярных реакций, приводит к образованию поло-жительных и отрицательных ионов, которые вытягиваются высоким потен-циалом ( ~ 25 кВ) из области ионизации и направляются в анализатор.Практически во всех коммерческих приборах используется времяпролет-ный анализатор, поскольку он характеризуется и неограниченным диапазо-ном масс, и наибольшей скоростью регистрации масс-спектра, а основной за-дачей МАЛДИ является как раз получение информации о молекулярной массе высокомолекулярных соединений. Кроме того, именно времяпролет-ные приборы лучше других работают с импульсными методами ионизации и обладают высочайшей чувствительностью, поскольку все образовавшиеся в результате ионизации ионы достигают детектора. Спектры после каждого лазерного импульса могут суммироваться для получения качественной ин-формации о молекулярной массе соединения. Обычно для приемлемого ре-зультата оказывается достаточно 30 – 50 лазерных импульсов.К недостаткам метода можно отнести тот факт, что некоторые незначимые ингредиенты неочищенных смесей иногда дают очень интенсивные пики в спектрах. Эти пики могут маскировать наличие действительно важных для исследователя компонентов, т.е. МАЛДИ не является методом количествен-ного анализа. Методы очистки проб для последующего МАЛДИ анализа описаны в обзоре (Y. Xu et al., 2003).1.3. Ионизация электрораспылением Первая работа по вводу водных растворов органических соединений в масс-спектрометр была выполнена под руководством Л.Н. Галль и опубликована в 1984 г. (М.Л. Александров и др., 1984). Предложенный авторами метод ЭРИАД (экстракция ионов из раствора при атмосферном давлении) явился не чем иным, как прообразом одной из наиболее популярных сегодня масс-спектрометрических техник ионизации – ионизация электрораспылением (ИЭР, Еlectrospray Ionization, ESI). Тем...

Внимание!
При обнаружении неточностей или ошибок в описании книги "Основы масс-спектрометрии белков и пептидов (автор Альберт Лебедев, Константин Артеменко, Татьяна Самгина)", просим Вас отправить сообщение на почту help@directmedia.ru. Благодарим!

Основы масс-спектрометрии белков и пептидов

Содержание

Отрывок из книги

Лебедев А. Т. другие книги автора